Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc5P32043 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc5P32043 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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