Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Saa4P31532 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms