Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxb1P17919 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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