Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms