Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim30aP15533 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms