Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fv4P11370 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fv4P11370 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms