Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

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Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc8P09025 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc8P09025 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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