Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zfp1P08042 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms