Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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