Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Serf1O88892 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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