Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec11aO88200 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms