Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm21887J3QQ04 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm21887J3QQ04 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm21887J3QQ04 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm21887J3QQ04 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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