Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c3J3QJW5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c3J3QJW5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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