Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms