Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h7bF8VPP8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms