Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms