Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm17175E9Q528 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17175E9Q528 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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