Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd2E9Q1M1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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