Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms