Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprbB2RU80 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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PtprbB2RU80 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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