Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema6cQ9WTM3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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