Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms