Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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