Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sall2Q9QX96 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms