Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dclk1Q9JLM8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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