Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tfr2Q9JKX3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfr2Q9JKX3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms