Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmbr1Q9JIT0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms