Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfcp2Q9ERA0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms