Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Capn12Q9ER56 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Capn12Q9ER56 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Capn12Q9ER56 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Capn12Q9ER56 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms