Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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