Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Smg9Q9DB90 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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