Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms