Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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