Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1lQ9D1E5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms