Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms