Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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