Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm26657Q9CVR1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm26657Q9CVR1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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