Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rprd1bQ9CSU0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms