Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms