Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nicn1Q9CQM0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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