Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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