Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dok4Q99KE3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms