Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ApobrQ8VBT6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms