Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf183Q8QZS5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms