Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mtmr3Q8K296 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mtmr3Q8K296 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mtmr3Q8K296 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mtmr3Q8K296 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms