Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG48

Smc2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc2Q8CG48 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smc2Q8CG48 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc2Q8CG48 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smc2Q8CG48 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smc2Q8CG48 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smc2Q8CG48 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smc2Q8CG48 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc2Q8CG48 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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