Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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