Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms