Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim19Q80ZU4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms