Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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